Na terenie gminy Morąg znajduje się wiele pomników przyrody, m.in. głaz granitowy (Lubin), szpaler dębów oraz park podworski (Markowo), park podworski (Wenecja), dąb oraz lipa (droga Słonecznik – Wenecja) i dąb (Strużyna).
Jezioro Skiertąg
Miejską atrakcją jest jezioro Skiertąg o powierzchni 0,75 km², przylegające do Morąga od północnego wschodu. Do jeziora wpływa i z niego wypływa rzeczka Drela, która kończy swój bieg w jeziorze Ruda Woda. Brzegi jeziora — zarówno od strony drogi wyjazdowej w kierunku Miłakowa, jak i od ulicy Przemysłowej — są stopniowo zagospodarowywane rekreacyjnie.
Przyroda i ptaki
Przy stadionie sportowym w Morągu znajduje się zabytkowy park leśny, a tzw. „Rozlewisko Morąskie” uznano za użytek ekologiczny ze względu na około 150 gatunków ptaków, w tym kilka unikatowych w skali europejskiej: kanię rdzawą, kanię czarną, orlika krzykliwego, trzmielojada, błotniaka zbożowego, orła bielika, krogulca i kobuza.
Nad jeziorem Morąg (na granicy z gminą Łukta), na Wyspie Lipowej, znajduje się rezerwat kormoranów i czapli siwych, a na granicy z gminą Miłakowo — rezerwat „Ostoja bobrów na rzece Pasłęce”, gdzie oprócz bobrów występują także wydry, norki amerykańskie, zimorodki, pstrągi i lipienie.